茉莉花茶的副作用主要有引起内分泌紊乱、月经失调、头晕目眩、增加肾脏负担、影响消化、贫血缺钙、引起失眠等。对于患有浅表性胃炎、胃溃疡、缺铁性贫血等人群则不建议喝茉莉花茶;女性在月经期、怀孕期、哺乳期、临产期、更年期等特殊时期也不建议饮用茉莉花茶。
茉莉花茶由茶叶和茉莉花混合而成,过多饮用会导致尿量增多,增加肾脏负担。大量饮用茉莉花茶,其中的咖啡因能兴奋神经中枢,尤其是睡前饮用茉莉花茶,可引起失眠。过量饮用或空腹饮用茉莉花茶,会使人饥饿,甚至会出现头晕目眩的症状;若在饭后立刻饮用茉莉花茶,还会影响消化。茉莉花茶含有鞣酸等成分,长期过量饮用会引起缺钙及缺铁性贫血,对于女性朋友来说严重者可能会出现内分泌紊乱及月经不调等现象。